Nature communications에 발표된 논문이다. 직접 재현해보지는 못했지만, 이 논문의 내용은 다음과 같이 요약할 수 있다.
1. TCGA의 LUAD 와 LUSC 의 H&E 사진과 스탠포드에서 보유중인 TMA의 사진을 비교함. 이 사진은 논문의 Figure는 frozen section 이나 모든 슬라이드가 frozen section 은 아닐 것으로 생각됨.
2. 이 검체에서 사진을 400배 배율로 여러장 촬영함. 그 이후 세포가 많은(자의적 기준 1) 10개를 선택했다고 함.
3. Broad institute에서 개발한 CellProfiler라는 프로그램을 사용하여 일련의 pipeline(프로그램을 사용해보면 일련의 알고리즘)을 통하여 세포의 형태에 관한 수치를 분석함.
4. 이렇게 분석한 수치를 바탕으로 생존 자료 등과 같은 여러 자료를 사용하여 분석을 시행함.
5. 그랬더니 Stage I 의 폐암 환자에서 예후와 관련있는 분류를 할 수 있었음.
이 논문에 대한 감상은 어떤 형태학적 특성이 있는지 언급이 없다는 것이다. 이러한 언급이 있다면 이러한 논문의 가치를 더 부여할 수 있을 것 같다.
이 방법의 연구는 큰 초기 비용은 없는데, 앞으로 연구 방법으로 고려해 볼려고 한다. 좋은 논문임.