RNA and FFPE

  파파핀 블럭 그러니깐 흔히 FFPE 라고 말하는 조직에서 RNA를 추출하게 된 지는 그렇게 오래 지나지 않았다. 그거는 별로 중요하지 않고 아무튼 Study를 계속 진행하기 위해서는 이 FFPE에서 RNA를 추출해야 하는데 일반적인 Protocol 로 할 경우 왠만하면 잘 된다는 연구가 있었다. 아무리 안나오더라도 3번 정도 시도하면 나온다는 그런 내용도 있었다.

All protocols extracted RNA from ten year old FFPE samples with a minimum RIN of 1.4. Gene expression of G6PD could be measured in all samples, old and recent, using RT-PCR primers designed for RNA fragments up to 151 bp.
(Reference: Ribeiro-Silva A, Zhang H, Jeffrey SS. RNA extraction from ten year old formalin-fixed paraffin-embedded breast cancer samples: a comparison of column purification and magnetic bead-based technologies. BMC Mol Biol 2007; 8: 118.)

  이제 다음 단계는 추출이 잘 되었는지 평가를 하기 위한 RT-PCR 과정이다. ㅡ_ㅡ;; 다시 공부하기 시작해야지.