공부해 봅시다/Pathology

Reference sequence 찾기

Anonymous Pathologist 2011. 1. 8. 21:19
Sequencing 결과를 해석하면서 판독하면서 사용하는 족보의 sequence 가 정말로 맞을까 생각을 했고, 이에 대한참고 자료를 찾고자 인터넷 서핑을 정말 열심히 했다. 그래서 Reference sequence 를 쉽게 찾는 방법을 찾을 수가 있었다.

1. NCBI 의 홈페이지 혹은 PubMed 에 들어간 후 상단의 search 항목에서 Gene 을 선택한다.
2. 원하는 유전자의 이름을 입력한다.
3. 우리는 사람이므로 Homo sapiens 항목을 선택한다.
4. 우측의 사이드바에서 reference sequence를 선택하거나 혹은 페이지 아래부분에서 mRNA and Proteins(s) 라고 되어 있는 부분을 찾는다. 보통 첫 번째에 언급된 것이 가장 흔한 종류이다. 그 중에서 잘 찾아보면 Consensus CDS 라는 항목이 있고, 이를 선택하면 원하는 결과를 찾을 수가 있다.

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