FISH for ALK

많은 환자분과 보호자분들이 빌어먹은 Crizotinib trial 때문에 병원을 방문한다. OTL
기본적으로 ALK에 대한 break-apart probe 를 사용하여 검사하고 있다. 구전되어온(??) 판독 기준에 대한 언급이 있는 최신의 논문에 대한 정보를 찾게 되어서 기록으로 남겨두려고 한다. :)

1. 몇 개의 핵을 살펴 보아야 하나?
FISH 염색이 잘 된 경우만을 포함한다고 할 경우 약 60개 정도면(4 field) 충분한 sensitivity 와 specificity 를 확보할 수 있다고 한다.

2. 양성 판독 기준은?
15% 이상의 종양 세포의 핵에서 다음과 같은 패턴이 가장 흔하게 관찰된다.
1) One normal fused signal 과 one splitted red and green signal (62%)
   (Split 된 기준은 2 signal diameter 이상으로 떨어져 있을 때)
2) One normal fused signal 과 one red signal (31%)

3. 관찰될 수 있는 패턴은?
1) "classic" ALK FISH-positive; 2.의 1)과 같은 식으로 관찰됨
2) two or more single red signals 이 관찰될 수 있다.
3) cluster of multiple single red and single green signals


Reference: Camidge DR, Kono SA, Flacco A, et al. Optimizing the detection of lung cancer patients harboring anaplastic lymphoma kinase (ALK) gene rearrangements potentially suitable for ALK inhibitor treatment. Clin Cancer Res 2010; 16: 5581-90.